近期有很多客戶(hù)使用我司(懋康生物)的Zymolyase-20T(酵母裂解酶,酵母溶壁酶)(Cat#:MF0212),經(jīng)常問(wèn)到產(chǎn)品如何溶解,使用劑量等問(wèn)題,現對以下問(wèn)題做出描述。有更多的問(wèn)題,請和我司聯(lián)系,或發(fā)郵件到tech@maokangbio.com。
常見(jiàn)問(wèn)題(Frequently asked questions):
一、 產(chǎn)品如何保存?
答復:本品以?xún)龈煞坌问教峁?,收到產(chǎn)品需2-8℃干燥保存。本品置于30℃,3個(gè)月酶活力損失約70%。本品溶于緩沖液配制成儲存液后,短期置于2-8℃保存,約2周穩定。長(cháng)期請置于-20℃保存,約數月穩定。
二、 凍干粉如何溶解?
答復:本品易溶于水。建議用1/15M phosphate buffer(pH 7.5)溶解,或用自己實(shí)驗體系相關(guān)緩沖液來(lái)溶解。儲存液的制備方法比較多,主要根據自身的實(shí)驗體系,或參考文獻來(lái)操作。短期置于2-8℃保存,約2周穩定。長(cháng)期請置于-20℃保存,約數月穩定。
三、 如何制備無(wú)菌酶溶液?
答復:若需要制備無(wú)菌酶溶液,請用除硝酸纖維素膜之外的0.22μm孔徑的濾膜過(guò)濾除菌。
四、 酶的比活力是多少?
答復:Zymolyase-20T指的是酶的比活力約20,000 units/g (20 Ku/mg),具體批次酶的比活力是有變化的,詳細請見(jiàn)產(chǎn)品標簽或質(zhì)檢報告。
五、 Zymolyase適用于哪些菌株類(lèi)型?
答復:該酶的裂解譜(lytic spectrum)包含以下菌屬:Ashbya(阿舒囊霉屬), Candida(假絲酵母菌屬), Debaryomyces(德巴利(氏)酵母屬), Eremothecium(假囊酵母屬), Endomyces(內孢霉), Hansenula(漢遜氏酵母), Hanseniaspora(孢漢遜酵母屬), Kloeckera(克勒克酵母屬), kluyveromyces(克魯維酵母屬), Lipomyces(油脂酵母屬), Metschnikowia(梅奇酵母屬), Pichia(畢赤酵母屬), Pullularia(芽霉菌屬), Torulopsis(球擬酵母菌), Saccharomyces(酵母屬), Saccharomycopsis(復膜酵母菌屬), Saccharomycodes(類(lèi)酵母屬), Schwanniomyces(許旺酵母菌屬),等等。其他未羅列在內的菌屬請查閱文獻或和我司聯(lián)系是否有相關(guān)應用數據。
六、 Zymolyase適用于絲狀真菌嗎?
答復:該酶主要用于酵母細胞壁的裂解,對于絲狀真菌,雖然與酵母細胞壁在結構上有很多相似,但裂解效果因菌株類(lèi)型有差異。建議用復合酶的形式來(lái)特異裂解絲狀真菌,或選用我司(懋康生物)提供的真菌溶壁酶(Cat#:MX7356)。
七、酶的工作濃度一般是多少?
不同的酵母菌株對酶的敏感性會(huì )有差異,請參閱文獻或根據實(shí)際的裂解經(jīng)驗來(lái)設定合適的工作濃度。操作方法可參考下方流程。
操作步驟(僅作參考,實(shí)際應用可做適當調整):
一、Zymolyase-20T儲存液制備
此配制方法針對以下步驟來(lái)設置,也可以適用其他適當的溶劑如1/15M phosphate buffer(pH 7.5) 、10mM Tris-HCl buffer(pH 7.5)等。
將低溫保存的凍干粉從冰箱取出,回置室溫,低速離心后,稱(chēng)取適量粉末溶于無(wú)菌S緩沖液(1.0 M Sorbitol, 10 mM PIPES, pH 6.5)配制成10mg/ml(200U/ml)儲存液,置于4℃能穩定保存2周(無(wú)菌條件下)。
二、制備原生質(zhì)球(Spheroplasting protocol)
2.1 室溫條件,5000rpm(3000 xg),5min離心酵母培養物;
2.2 吸掉上清,收集離心沉淀(酵母細胞),記錄濕重;
2.3 用TE緩沖液(100 mM Tris,pH 8.0,100 mM EDTA)重懸酵母細胞,按照1.4ml/g濕重細胞加量。并用去離子水定容到終體積 3.5ml/g濕重細胞。
2.4 按照17.5 μl/g濕重細胞加入? -巰基乙醇,目的是為了除去細胞外層甘露聚糖層;
2.5 30°C孵育并保持低速搖晃,處于對數期生長(cháng)的酵母孵育15min,處于穩定期生長(cháng)的酵母孵45min;
2.7 用S緩沖液(1.0 M Sorbitol, 10 mM PIPES, pH 6.5)重懸細胞,加4.0ml S緩沖液/g濕重細胞;
2.9 再次用S緩沖液(4.0ml/g濕重細胞)重懸細胞,另加入Zymolyases(50U/g濕重細胞,對200U/ml儲存液,則加入250μl);初始用此酶,最好根據實(shí)際情況進(jìn)行用量的優(yōu)化。
2.10 30°C輕搖溫育混合液30min,根據以下方式監測原生質(zhì)球形成程度:
a)加1μl樣品到20μl S 緩沖液內,原生質(zhì)球應該保持完整;b)加1μl樣品到20μl去離子水中,原生質(zhì)球應該破裂;顯微鏡下觀(guān)察比較兩個(gè)樣品。
2.11 一般情況下反應45-60min,原生質(zhì)球的形成量>90%,此時(shí)4oC下離心收集細胞,5000rpm,5min;
2.12 再次用S緩沖液(2 ml/g濕重細胞)重懸原生質(zhì)球,5000rpm離心5min;重復此步驟2次。
2.13 原生質(zhì)球沉淀可置于-70oC凍存。
三、酵母基因組DNA的制備(Preparation of yeast genomic DNA)
以下操作步驟簡(jiǎn)單快速,適合于少量酵母培養物內基因組DNA的制備。
3.1 將過(guò)夜培養的10ml酵母菌培養物離心收集沉淀,加入280μl TE Buffer,300 μl 去離子水和3 μl ? -巰基乙醇;
3.3 30oC溫育45min;
3.3 以臺式離心機的最高速度離心2-3s,棄上清液,沉淀用500μl S 緩沖液重懸.;再次離心棄上清;
3.4 用500μl含有1 mg/ml Zymolyase 20T的S緩沖液重懸沉淀(或者使用自行優(yōu)化后的最佳酶濃度);
3.5 30oC溫育1h;
3.6 重復步驟3.3;
3.7 用200μl含有0.1%SDS和2ug蛋白酶K的TE buffer重懸沉淀;
3.8 37oC溫育3小時(shí),中間時(shí)不時(shí)的混勻下溶液;
3.9 轉到65oC溫育20min;從水浴鍋內取出并冷卻至室溫;
3.10 用200μl 1:1的Tris飽和酚-氯仿混合液萃取,漩渦混勻并離心;從離心機內取出并保留上清液;
3.11 用200μl氯仿萃取上清液,之后重復漩渦混勻及離心;
3.12 加入500μl 95%乙醇到上清液內,20oC沉淀10min;
3.13 4oC下,15,000 xg離心20 min;
3.14 自然風(fēng)干或者于真空離心蒸發(fā)濃縮器內晾干除去多余的乙醇,并加入200μl TE緩沖液(含有150 mM NaCl和1 μg RNase A)溶解DNA;
3.15 37oC溫育1小時(shí);
3.16 重復步驟3.10和3.11;
3.17 加入2.5倍體積的95%乙醇,20oC沉淀10min;
3.18 30μl去離子水重懸DNA。對1:500的DNA稀釋液測量A260,根據消光系數計算DNA產(chǎn)量;產(chǎn)量大約為40-50μg。